Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PcnaP17918 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PcnaP17918 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PcnaP17918 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PcnaP17918 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
PcnaP17918 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
PcnaP17918 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms