Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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Pou4f1P17208 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Pou4f1P17208 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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