Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Mthfr-202ENSMUST00000097788 2652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Polq-202ENSMUST00000071452 7290 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Sp3-201ENSMUST00000066003 3808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm14565-201ENSMUST00000140021 2494 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm26780-201ENSMUST00000180748 2495 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Sh2d7-201ENSMUST00000060242 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Ciapin1-209ENSMUST00000162538 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Ehmt1-210ENSMUST00000147147 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gpm6b-204ENSMUST00000112226 3174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Vpreb1P13372 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms