Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Vmn1r228-201ENSMUST00000072410 1443 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Dppa3-ps-201ENSMUST00000116499 451 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm13260-201ENSMUST00000117797 1264 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm12345-201ENSMUST00000119288 898 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm25179-201ENSMUST00000122632 128 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Cd48-201ENSMUST00000015499 922 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 C130080G10Rik-204ENSMUST00000155185 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Vmn1r-ps141-201ENSMUST00000176293 753 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm20663-201ENSMUST00000176647 474 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm3376-201ENSMUST00000180202 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm27155-201ENSMUST00000183716 898 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Mir7088-201ENSMUST00000184227 86 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Scgb1b25-ps-201ENSMUST00000186419 415 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm21294-201ENSMUST00000186443 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 4930401A07Rik-201ENSMUST00000214657 746 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 AC157017.2-201ENSMUST00000218354 777 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 AC123658.1-201ENSMUST00000228364 867 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Pik3c2g-201ENSMUST00000032353 1206 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Cd40lg-201ENSMUST00000033466 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm10053-201ENSMUST00000073080 949 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Olfr193-201ENSMUST00000076262 1009 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm10145-201ENSMUST00000077776 462 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm10705-201ENSMUST00000098980 461 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm20756-201ENSMUST00000201080 1595 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxb4P10284 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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