Protein–RNA interactions for Protein: P01662

Ig kappa chain V-III region ABPC 22/PC 9245, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01662 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01662 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01662 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01662 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01662 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01662 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01662 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01662 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01662 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01662 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01662 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01662 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01662 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01662 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01662 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01662 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01662 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01662 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01662 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01662 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01662 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01662 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01662 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01662 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01662 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01662 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01662 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01662 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01662 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01662 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01662 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01662 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01662 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01662 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01662 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01662 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01662 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01662 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01662 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01662 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01662 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01662 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01662 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01662 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01662 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01662 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01662 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01662 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01662 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01662 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01662 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01662 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01662 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01662 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01662 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01662 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01662 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01662 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01662 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01662 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01662 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01662 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01662 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01662 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01662 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01662 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01662 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01662 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01662 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01662 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01662 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01662 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01662 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01662 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01662 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01662 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01662 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01662 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01662 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01662 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01662 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01662 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01662 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01662 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
P01662 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01662 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms