Protein–RNA interactions for Protein: P01661

Ig kappa chain V-III region MOPC 63, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01661 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01661 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01661 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01661 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01661 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
P01661 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
P01661 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01661 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01661 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01661 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01661 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01661 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01661 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01661 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01661 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01661 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01661 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01661 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01661 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01661 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01661 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01661 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01661 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01661 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01661 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01661 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01661 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01661 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01661 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01661 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01661 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01661 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
P01661 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01661 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01661 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01661 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01661 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01661 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01661 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01661 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01661 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01661 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01661 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01661 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
P01661 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01661 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01661 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01661 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01661 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01661 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
P01661 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms