Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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Sp100O35892 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
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Sp100O35892 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sp100O35892 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sp100O35892 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Sp100O35892 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Sp100O35892 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Sp100O35892 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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Sp100O35892 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sp100O35892 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
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