Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Olfr282-204ENSMUST00000215320 1573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm2035J3QP87 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2035J3QP87 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2035J3QP87 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2035J3QP87 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2035J3QP87 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2035J3QP87 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2035J3QP87 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2035J3QP87 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2035J3QP87 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2035J3QP87 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2035J3QP87 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2035J3QP87 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2035J3QP87 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2035J3QP87 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2035J3QP87 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2035J3QP87 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2035J3QP87 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2035J3QP87 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2035J3QP87 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2035J3QP87 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2035J3QP87 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2035J3QP87 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm2035J3QP87 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms