Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Grpr-201ENSMUST00000033730 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Mcm5-205ENSMUST00000212811 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Kcnj5-202ENSMUST00000214223 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Acad10-202ENSMUST00000111770 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Skiv2l-201ENSMUST00000046022 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Gfap-202ENSMUST00000077902 2600 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 P3h1-202ENSMUST00000081606 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 4632411P08Rik-201ENSMUST00000181005 3237 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Park2-209ENSMUST00000191124 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Fam217a-202ENSMUST00000223834 2253 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Adcy3-201ENSMUST00000020984 4348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Dlgap2-208ENSMUST00000150247 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Ccdc33-204ENSMUST00000119665 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Gm15953-201ENSMUST00000117656 1732 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Ctc1-211ENSMUST00000161455 3989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Tmem63a-205ENSMUST00000161523 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Hsd3b5-201ENSMUST00000044094 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Dpf2-205ENSMUST00000136983 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Smim18J3QNP2 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms