Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Prss55-201ENSMUST00000089338 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gm5870-201ENSMUST00000196461 282 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 1700001C02Rik-202ENSMUST00000114743 729 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ScaperF8VQ70 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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