Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm11871-201ENSMUST00000122429 1061 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm11309-201ENSMUST00000127108 613 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 A330043C09Rik-201ENSMUST00000139823 1009 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm15995-201ENSMUST00000159897 574 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm27155-201ENSMUST00000183716 898 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm19066-201ENSMUST00000193232 1078 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 2510017J16Rik-201ENSMUST00000198718 1263 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 AL603630.1-201ENSMUST00000214781 147 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm18705-201ENSMUST00000215985 913 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Pah-204ENSMUST00000219813 789 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Cbx3-202ENSMUST00000094623 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 1700080N15Rik-202ENSMUST00000154360 1316 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Vmn1r36-203ENSMUST00000226728 1458 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm28649-201ENSMUST00000189153 1581 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
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Gm3250E9Q1M3 Olfr895-202ENSMUST00000212156 1558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 C030005K15Rik-201ENSMUST00000166373 1882 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Olfr800-201ENSMUST00000104903 940 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Gm3250E9Q1M3 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
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