Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6R0

Gm5478, Predicted pseudogene 5478, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5478D3Z6R0 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Nkap-201ENSMUST00000016553 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm5478D3Z6R0 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
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Gm5478D3Z6R0 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Tia1-201ENSMUST00000095752 3130 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Gm5478D3Z6R0 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Abcc4-201ENSMUST00000036554 5715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gm5478D3Z6R0 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gm5478D3Z6R0 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Gm5478D3Z6R0 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Tmem33-201ENSMUST00000037918 6247 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Anln-201ENSMUST00000040912 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Gm5478D3Z6R0 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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