Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm45132-201ENSMUST00000207234 2542 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm3543D3Z235 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
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