Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Ezr-201ENSMUST00000064234 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rd3lB2RV38 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms