Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H60cB1B213 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H60cB1B213 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H60cB1B213 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H60cB1B213 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H60cB1B213 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H60cB1B213 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H60cB1B213 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H60cB1B213 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms