Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Mrpl40Q9Z2Q5 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Mrpl40Q9Z2Q5 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Mrpl40Q9Z2Q5 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Mrpl40Q9Z2Q5 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Mrpl40Q9Z2Q5 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Mrpl40Q9Z2Q5 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms