Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Cldn8Q9Z260 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.2 ms