Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Nme3Q9WV85 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms