Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Nubp2Q9R061 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Nubp2Q9R061 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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Nubp2Q9R061 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Nubp2Q9R061 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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