Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Cfb-207ENSMUST00000176203 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rnf4Q9QZS2 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rnf4Q9QZS2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rnf4Q9QZS2 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Rnf4Q9QZS2 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Rnf4Q9QZS2 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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