Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Rabgef1Q9JM13 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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Rabgef1Q9JM13 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Rabgef1Q9JM13 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Rabgef1Q9JM13 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Rabgef1Q9JM13 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Rabgef1Q9JM13 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Rabgef1Q9JM13 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Rabgef1Q9JM13 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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