Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Gm8152-201ENSMUST00000120842 637 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Prg3Q9JL95 Gm4868-201ENSMUST00000164138 789 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms