Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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Usp29Q9ES63 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Usp29Q9ES63 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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