Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Mpp4-203ENSMUST00000114275 2982 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Arhgap24-205ENSMUST00000112853 2853 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Cped1-201ENSMUST00000115382 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Hmg20aQ9DC33 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
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