Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Cd300lg-202ENSMUST00000107163 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ccdc97Q9DBT3 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ccdc97Q9DBT3 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Ccdc97Q9DBT3 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Ccdc97Q9DBT3 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc97Q9DBT3 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc97Q9DBT3 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc97Q9DBT3 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc97Q9DBT3 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc97Q9DBT3 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc97Q9DBT3 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc97Q9DBT3 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc97Q9DBT3 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc97Q9DBT3 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc97Q9DBT3 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc97Q9DBT3 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc97Q9DBT3 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc97Q9DBT3 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Ccdc97Q9DBT3 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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