Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Usp12Q9D9M2 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Usp12Q9D9M2 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms