Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Tctex1d1-205ENSMUST00000140654 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Vipr2-201ENSMUST00000011315 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Nop56Q9D6Z1 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Nop56Q9D6Z1 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Nop56Q9D6Z1 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Nop56Q9D6Z1 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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