Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Itgb1bp1-202ENSMUST00000172834 801 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Gm25677-201ENSMUST00000174983 72 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Phf6Q9D4J7 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Phf6Q9D4J7 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Gm16240-201ENSMUST00000161924 614 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 CT030652.1-201ENSMUST00000227377 1235 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Phf6Q9D4J7 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms