Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms