Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ccdc47Q9D024 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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