Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Olfr71-203ENSMUST00000217544 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Sec16a-201ENSMUST00000091252 8737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Tmem184a-202ENSMUST00000110832 4326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Ddx28Q9CWT6 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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