Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Commd4Q9CQ02 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Commd4Q9CQ02 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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