Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

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Length 314 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Atg3Q9CPX6 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm11502-201ENSMUST00000120917 1211 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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Atg3Q9CPX6 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Atg3Q9CPX6 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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