Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

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Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Slc8b1Q925Q3 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Slc8b1Q925Q3 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Slc8b1Q925Q3 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Slc8b1Q925Q3 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Slc8b1Q925Q3 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Slc8b1Q925Q3 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms