Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Dclk1-213ENSMUST00000199702 2922 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Tank-203ENSMUST00000112495 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rdh10Q8VCH7 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms