Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Top1mtQ8R4U6 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Top1mtQ8R4U6 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Top1mtQ8R4U6 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Top1mtQ8R4U6 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Top1mtQ8R4U6 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Top1mtQ8R4U6 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Top1mtQ8R4U6 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Top1mtQ8R4U6 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Top1mtQ8R4U6 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Top1mtQ8R4U6 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Top1mtQ8R4U6 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Top1mtQ8R4U6 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Top1mtQ8R4U6 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Top1mtQ8R4U6 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Top1mtQ8R4U6 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Top1mtQ8R4U6 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Top1mtQ8R4U6 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Top1mtQ8R4U6 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms