Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Vmn1r200Q8R281 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Vmn1r200Q8R281 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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