Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pkn3Q8K045 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pkn3Q8K045 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms