Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF1

Arhgap29, Rho GTPase-activating protein 29, mousemouse

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Length 1,266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap29Q8CGF1 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap29Q8CGF1 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap29Q8CGF1 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap29Q8CGF1 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap29Q8CGF1 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap29Q8CGF1 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap29Q8CGF1 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap29Q8CGF1 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap29Q8CGF1 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap29Q8CGF1 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap29Q8CGF1 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap29Q8CGF1 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap29Q8CGF1 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap29Q8CGF1 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap29Q8CGF1 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap29Q8CGF1 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap29Q8CGF1 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap29Q8CGF1 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap29Q8CGF1 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap29Q8CGF1 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap29Q8CGF1 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap29Q8CGF1 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap29Q8CGF1 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Arhgap29Q8CGF1 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Ticam2-201ENSMUST00000070084 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Arhgap29Q8CGF1 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Arhgap29Q8CGF1 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Arhgap29Q8CGF1 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Arhgap29Q8CGF1 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Arhgap29Q8CGF1 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Arhgap29Q8CGF1 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Arhgap29Q8CGF1 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms