Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
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Hpf1Q8CFE2 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Hpf1Q8CFE2 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Hpf1Q8CFE2 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Hpf1Q8CFE2 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Hpf1Q8CFE2 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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