Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cdkl1Q8CEQ0 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms