Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Usp27Q8CEG8 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
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Usp27Q8CEG8 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Usp27Q8CEG8 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Usp27Q8CEG8 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Usp27Q8CEG8 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Usp27Q8CEG8 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Usp27Q8CEG8 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Usp27Q8CEG8 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
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Usp27Q8CEG8 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Usp27Q8CEG8 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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Usp27Q8CEG8 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Usp27Q8CEG8 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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Usp27Q8CEG8 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Usp27Q8CEG8 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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