Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm15614-201ENSMUST00000155976 1537 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm10778-201ENSMUST00000105315 1497 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm4767-201ENSMUST00000099439 1497 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Trav10-201ENSMUST00000103583 406 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm15766-201ENSMUST00000118025 813 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm17046-201ENSMUST00000168078 850 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm29072-201ENSMUST00000191149 678 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm37111-201ENSMUST00000193250 634 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm44577-201ENSMUST00000207413 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm18907-201ENSMUST00000209719 932 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 AC152922.1-201ENSMUST00000216518 1232 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 AC152946.3-201ENSMUST00000219424 280 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Olfr1015-201ENSMUST00000047870 1016 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Olfr911-ps1-201ENSMUST00000074987 940 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm1330-201ENSMUST00000081553 474 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm7237-201ENSMUST00000148435 1401 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm45088-201ENSMUST00000207066 1408 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 AC155710.1-201ENSMUST00000219913 1353 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Trim35Q8C006 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Trim35Q8C006 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm15923-201ENSMUST00000119300 1169 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
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Trim35Q8C006 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm12269-201ENSMUST00000122273 717 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Trav7-3-201ENSMUST00000177622 402 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Olfr1228-201ENSMUST00000190757 1094 ntAPPRIS P2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Olfr416-ps1-201ENSMUST00000192734 804 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm43004-201ENSMUST00000201872 703 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 Gm45830-201ENSMUST00000212945 344 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim35Q8C006 AC132384.13-201ENSMUST00000219556 1159 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms