Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
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Rbbp5Q8BX09 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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Rbbp5Q8BX09 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
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Rbbp5Q8BX09 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Rbbp5Q8BX09 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Rbbp5Q8BX09 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Rbbp5Q8BX09 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Rbbp5Q8BX09 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Rbbp5Q8BX09 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Rbbp5Q8BX09 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms