Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usp38Q8BW70 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usp38Q8BW70 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usp38Q8BW70 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Usp38Q8BW70 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Usp38Q8BW70 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usp38Q8BW70 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Usp38Q8BW70 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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