Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW22

Ss18l1, Calcium-responsive transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l1Q8BW22 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Schip1-202ENSMUST00000169909 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ss18l1Q8BW22 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms