Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Sp100-201ENSMUST00000054279 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Dyrk1a-203ENSMUST00000122284 2356 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm10748-202ENSMUST00000194396 2379 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Kmt2a-202ENSMUST00000114689 16470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Amph-201ENSMUST00000003345 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Sgk2-202ENSMUST00000117123 3034 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Slco5a1-205ENSMUST00000146763 3437 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Efna5-201ENSMUST00000076840 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 5930420M18Rik-201ENSMUST00000202893 2281 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Pdcl3Q8BVF2 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Pdcl3Q8BVF2 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Pdcl3Q8BVF2 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Mid1-202ENSMUST00000078947 3591 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Eno4-202ENSMUST00000200910 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Eno4-201ENSMUST00000054280 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Nedd1-201ENSMUST00000020163 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Fam217a-202ENSMUST00000223834 2253 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Kcnj5-202ENSMUST00000214223 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Habp2-202ENSMUST00000095948 2815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Dcun1d4-201ENSMUST00000063882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Thbs3-202ENSMUST00000119084 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Sema4g-203ENSMUST00000179305 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Robo4-202ENSMUST00000115046 3878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gpr68-202ENSMUST00000110065 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Rab2b-201ENSMUST00000022765 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdcl3Q8BVF2 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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