Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Atg4dQ8BGV9 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Atg4dQ8BGV9 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Atg4dQ8BGV9 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
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Atg4dQ8BGV9 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4dQ8BGV9 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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