Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 2810408I11Rik-201ENSMUST00000122813 435 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
H2-M10.4Q85ZW8 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms