Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW7

H2-M10.5, Histocompatibility 2, M region locus 10.5, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.5Q85ZW7 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
H2-M10.5Q85ZW7 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms